馬祖可以分成「蜻蜓點水式」與「鑽木取火式」，蜻蜓點水式，以跳躍分成島嶼重點式環遊，而鑽木取火則是深度旅遊鑽入每座島嶼融合其中，建議規劃較長的時間進駐，而旅遊時節挑選上，可搭配四季分明的馬祖，更可突顯出每一位旅行者的「旅遊性格」。春季漫遊薄霧與桃花相映的寧靜公路上，兩側的桃花、櫻花漫天飛舞，猶如置身桃花源，浪漫文青在此沉澱構思創作題材，藝術家選擇在此流浪放逐思緒，情侶在桃花源中互訴衷情，知名作家九把都曾在「會呼吸的房子」中撰寫新作；馬祖的春天，水氣豐沛，適合一趟心靈滋潤之旅。
夏天，環抱蔚然海洋，旅客乘著快艇徜徉其中，莒光海洋文化季開跑，觀賞最神秘的過境燕鷗「神話之鳥」，以及取自大海中的新鮮食材，享受美酒美食，滿足熱情健康的旅人，騎著自行車、划行獨木舟挑戰馬祖極限運動，盡情逍遙探索大自然。
秋高氣爽，馬祖宗教展開秋慶饗宴，在中秋節與重陽節粉墨登場，最特殊的中秋燒塔節與媽祖昇天祭，在世界第一高的媽祖石神像前，虔誠走完祈福坑道，循著廟宇地圖朝聖「廟比住戶多，神明比人多」的橋仔村，一窺馬祖宗教風采。
冬天的冷冽是挑戰低溫，戰鬥力十足的磯釣運動，適合熱衷冒險的旅人，馬祖有登山怪傑李小石，在嚴峻的環境中鍛鍊堅毅性格，攀登世界險峰的傳奇，讓人嘖嘖稱奇!在這裡駐足軍事據點包括鐵堡、北海坑道等，最能感受戰地前哨的緊張氛圍；在低溫中來碗老酒麵線或是馬祖老酒、高粱驅寒；在元宵鑼鼓炮聲中，觀看難得一見的「扛轎文化」，元宵擺暝文化季可讓您體驗最刺激、繽紛的傳統陣頭嘉年華，並乘著最便捷的小三通船班，90分鐘航程往返兩岸，共度「兩馬鬧元宵」文化交流之旅。
另外，立榮航空每日眾多航班前往馬祖，民眾可以多加利用。
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